¡Hermanos contra enemigos! A cada paso, las Tortugas Ninja han frustrado los planes de Kraang Supremo de terraformar la Tierra en la Dimensión X. ¿Y que es lo típico que haría un malvado jefe supremo? ¡Pues idear un plan infame para crear un ejército de ultramutantes! Los Kraang han ido por todas partes secuestrando mutantes por su ADN, ¡incluidas las Tortugas Ninja!